Spółka komandytowa odprowadzi więc podatek dochodowy od osób prawnych, a następnie – podobnie jak ma miejsce w przypadku spółek kapitałowych – opodatkowaniu podlegał będzie wypłacany wspólnikom zysk. Jednak zarówno w odniesieniu do komplementariusza, jak i komandytariusza, projekt przewiduje pewne mechanizmy obniżające wysokość efektywnego opodatkowania takich zysków.
Opodatkowanie spółki komandytowej
Spółki komandytowe będą płaciły podatek CIT od uzyskanych dochodów na identycznych zasadach jak inni podatnicy CIT, czyli co do zasady według stawki 19%. Jeśli jednak przychody spółki ani z bieżącego, ani z poprzedniego roku podatkowego nie przekroczą progu 2 mln euro, spółka będzie miała prawo do zastosowania stawki 9%. Warto zauważyć, że projekt przewiduje podniesienie obecnego limitu ograniczającego możliwość zastosowania stawki 9% z 1,2 do 2 mln euro. Należy przy tym podkreślić, że przekroczenie limitu choćby o złotówkę spowoduje automatyczne zastosowanie podstawowej stawki podatkowej do całości dochodów, również poniżej limitu.
Opodatkowanie wspólników spółki komandytowej
Projekt przewiduje różne zasady opodatkowania dla komplementariusza i dla komandytariusza.
a. Opodatkowanie zysku wypłaconego komandytariuszowi
Zysk wypłacany komandytariuszowi będzie podlegał opodatkowaniu zryczałtowanym podatkiem dochodowym według stawki 19%.
Nowelizacja przewiduje zwolnienie z opodatkowania części przychodów komandytariusza, uzyskanych z udziału w spółce komandytowej. Zwolnieniu podlegałoby 50% uzyskanych przez komandytariusza przychodów z tego tytułu, nie więcej jednak niż 60.000 zł rocznie. W tym przypadku zastosowano inny mechanizm, niż w przypadku stawki CIT. Przekroczenie kwoty przychodów oznacza bowiem konieczność opodatkowania tylko nadwyżki ponad kwotę zwolnioną. Zwolnienie do limitu 60.000 zł znajdzie zastosowanie do przychodu uzyskanego z każdej spółki komandytowej, której wspólnikiem jest komandytariusz.
Jeśli jednak komandytariusz będzie wspólnikiem posiadającym więcej niż 5% udziałów lub członkiem zarządu spółki kapitałowej będącej komplementariuszem w tej spółce, nie będzie miał prawa do zwolnienia. Nie skorzysta z niego również członek zarządu spółki kapitałowej będącej udziałowcem komplementariusza. Zwolnienie nie będzie przysługiwało także komandytariuszom powiązanym, np. rodzinnie, z członkami zarządu lub wspólnikami, a nawet pośrednio, spółek kapitałowych będących komplementariuszami.
Oznacza to, że w przypadku najczęściej stosowanej w Polsce struktury – spółki komandytowej, w której komandytariuszami są udziałowcy komplementariusza będącego spółką kapitałową, zwolnienie w ogóle nie będzie przysługiwało.
b. Opodatkowanie zysku wypłaconego komplementariuszowi
Zysk wypłacany komplementariuszowi będzie opodatkowany zryczałtowanym podatkiem dochodowym według stawki 19%.
Projekt przewiduje jednak, że komplementariusz będzie mógł pomniejszyć „swój” podatek do zapłaty o taką część podatku CIT zapłaconego przez spółkę komandytową, w jakiej komplementariusz uczestniczy w zysku tej spółki. W przypadku spółki komandytowej opodatkowanej stawką obniżoną do 9%, w momencie wypłaty zysku komplementariusz będzie musiał dopłacić efektywnie 10% (poziom opodatkowania wyrówna do poziomu 19%). W praktyce zyski komplementariusza nadal więc będą podlegały jednokrotnemu opodatkowaniu, a efektywna stawka opodatkowania wyniesie maksymalnie 19%.